北京大学已经成为一所拥有自然科学、技术科学、新型工程科学以及人文科学、社会科学、管理科学、教育科学、医药科学和语言科学等多种学科的新型综合性大学，尤其建立了很有特色的北京大学交叉学科研究院，其中包括前沿纳米科技、理论与系统生物学和生物医药跨学科研究中心等，充分发挥着人才培养、科学研究、社会服务的功能。　目前北京大学的教学单位分为理学部、信息与工程科学部、人文学部、社会科学部、医学部和跨学科类六大类。
理学部
　　数学科学学院，物理学院，化学与分子工程学院，生命科学学院，地球与空间科学学院，城市与环境学院，心理学系
信息与工程科学部
　　信息科学技术学院，计算机科学技术研究所，软件与微电子学院，环境科学与工程学院，工学院
人文学部
　　中国语言文学系，历史学系，考古文博学院，哲学系（宗教学系），外国语学院，艺术学院，对外汉语教育学院
社会科学部
　　国际关系学院，经济学院，光华管理学院，法学院，信息管理系、社会学系，政府管理学院，马克思主义学院，教育学院，新闻与传播学院，人口研究所，国家发展研究院，体育教研部
医学部
　　基础医学院，药学院，公共卫生学院，护理学院，公共教学部，医学人文研究院，医学网络教育学院，第一医院，人民医院，第三医院，口腔医院，第六医院，北京肿瘤医院，深圳医院 ，首钢医院12所教学医院
跨学科类
　　元培学院，先进技术研究院，前沿交叉学科研究院，中国社会科学调查中心，分子医学研究所
深圳研究生院
　　汇丰商学院，国际法学院，人文社会科学学院，化学生物学与生物技术学院，环境与能源学院，信息工程学院，城市规划与设计学院